臺灣菸酒為國營事業，薪資、獎金等相關政策依據《財政部所屬事業機構用人費薪給管理要點》訂定《臺灣菸酒股份有限公司從業人員薪給要點》及《核發經營績效獎金應行注意事項》執行。薪資核支也依據主管機關財政部核定辦理，不因為性別而有所差異。臺灣菸酒提供具競爭力的薪酬福利制度，基層人員薪資水準如右圖
臺灣菸酒員工薪資係依據「公營事業機構員工待遇授權訂定基本原則」及「財政部所屬事業機構用人費薪給管理要點」辦理。

臺灣菸酒依法設計完善的退休制度，包含正式員工退休金提撥與給付，為感念員工為公司畢生之付出，於員工退休時致贈退休紀念品。另設有勞工退休準備金監督委員會、職工退休基金管理委員會以監督退休金之保管運用與分配。