臺灣菸酒的酒類暨生技研究所負責統籌核心原物料及技術研究，建立檢驗機制。此外，各事業部之研發中心亦設置實驗室檢驗原料與產品，針對成品與半製品依主管機關公告或自行開發的方法進行檢驗，確保臺灣菸酒生產之產品品質安全無虞。

為確保檢測能力及品質符合國際水準，酒類暨生技研究所之酒類分析實驗室及豐原捲菸研發製造工廠的菸類檢測實驗室皆通過財團法人全國認證基金會（Taiwan Acceptation Foundation, TAF）之實驗室認證。各事業部之研發中心擁有多項分析技術，在嚴謹的檢驗機制把關下，2018 年臺灣菸酒無任何違反產品安全性法規之情事。

我們投入許多成本進行外部檢驗，確保生產之產品無任何不應該添加或存在之化學物，2018 年所有外部檢驗項目合格率為100%，檢驗項目包含黃麴毒素、赭麴毒素、重金屬( 鉛、鎘、汞)、農藥殘留、塑化劑、黴菌毒素、直鏈或支鏈澱粉含量、動物用藥殘留等，相關檢驗均符合國家或國際標準。

此外，臺灣菸酒所生產啤酒相關原料，於交貨前，皆要求供應商提出農藥殘留及符合衛生法規之檢驗報告，100％合格才能收料使用。

啤酒研發中心另為大麥芽、啤酒花及濕式矽膠依使用需求及食品安全衛生相關法規進行檢驗。