臺灣菸酒以提供品質與安全兩者兼具的產品為己任，制定了「臺灣菸酒股份有限公司全面品質管理（TQM）施行要點」，建立「全面品質管理（Total Quality Management, TQM）」組織架構，設立決策與諮詢委員會，希冀透過系統化架構進行品質管理相關決策，落實並優化公司整體食品安全管理系統，創造「責任生產」的永續價值。
本公司同時也建置了第三方專家諮詢機制，邀請外部專家提出建議與需求，使管理過程更為客觀且多元；並與 TQM 決策委員會或各事業部針對現況進行 7 大施行面向的評鑑、提出改善建議，並每季追蹤執行成效檢討，以完善食品追溯制度以及系統化的供應商管理模式。

臺灣菸酒依據《臺灣菸酒股份有限公司品質保證委員會設置要點》於 2014 年設立「品質保證委員會」，審核及督導各事業單位提出之產品衛生安全管理、溯源管理及消費者保護相關計畫，並於每季召開會議。同時所有事業部皆建立產品鑑別與追溯追蹤管理程序，並納入 ISO 控管，以實現食品安全衛生的承諾。